Florestas alagadas são aquelas inundadas com água doce, permanentemente ou sazonalmente, ao longo do curso dos rios e em torno de lagos de água doce. São encontradas em uma variedade de zonas climáticas, desde boreais até temperadas e subtropicais a tropicais. No Brasil as florestas alagadas são encontradas principalmente na Amazônia e as flutuações do nível da água podem chegar a 10 metros ou mais, com os alagamentos ocorrendo sempre no período de março a setembro. 
As águas dos rios da Amazônia possuem características diferentes, resultantes da geologia das suas bacias fluviais. Os rios chamados de rios de água branca ou turva, como o Solimões ou o Madeira, passam por terras ricas em minerais e suspensões orgânicas. Os rios chamados de água preta, como o Negro, oriundos de terras arenosas pobres em minerais, são transparentes e de cor marrom pelas substâncias húmicas, que se formam a partir da degradação química e biológica de resíduos de plantas, animais e atividades microbianas. Existem também rios de águas claras, como o Tapajós, que nascem nas áreas dos antigos escudos continentais, também pobres em minerais e nutrientes. As matas banhadas pelas águas brancas (Solimões) costumam ser chamadas de florestas de várzea e as banhadas pelas águas pretas (Negro) e pelas claras (Tapajós), de florestas de igapós. A vegetação da várzea é muito mais rica do que a vegetação dos igapós, por causa da fertilidade das águas brancas e dos solos aluvionais, provenientes de deposições sucessivas de materiais transportados e depositados pelos cursos de água.
As plantas e os animais da floresta alagada na Amazônia vivem em função das suas diversas adaptações especiais para sobreviver durante as enchentes. As árvores das matas alagadas têm várias adaptações para sobreviverem quando estão submersas como raízes respiratórias e sapopembas (https://www.iguiecologia.com/samauma/ ), outra mudança em relação a florestas que não ficam alagadas é que não existem plantas epífitas (plantas que vivem sobre outra planta), nem plantas menores ao redor das plantas maiores. 
Os mamíferos que vivem nessas áreas são bons nadadores, como as antas e capivaras por exemplo. A fauna de primatas e outros animais que vivem nos topos das árvores é bem menor comparado com áreas que não alagam. Uma curiosidade…. nesses locais são encontrados diversos peixes que se alimentam de frutos, como o tambaqui e o pacu, uma dieta improvável em locais que não alagam.